氮肥施用量不能过多的原因还与非离子氨的毒性有关 。众所周知，总氨在水中形成铵 (nh4 )和非离子氨 (nh3)，ph越高，水温越高，非离子氨在总氨中所占百分比越大，水的毒性就越强 。有些养鱼场施大量硫铵后当时未见不良反应，一两天后随着浮游植物的大量增长，中午前后水的ph值和水温都升高，就出现大量死鱼 。有时虽未大量死鱼，但鱼的生长受抑制 。
原苏联学者根据光合强度试验，推荐无机氮肥的施用量为1～2mg/l;以色列为1.4mg/l，其他国家关于氮肥的施用量一般也不超过2mg/l 。
水底沉积物是浮游植物生长的主要磷源，当浮游植物大量繁殖吸收磷酸盐时，沉积物将释放磷酸盐 。但是施肥池塘浮游植物对磷的吸收速率通常要较底泥的释放率大4.5-5.5倍，因此施磷肥是必要的 。
浮游植物细胞中氮和磷的质量比值因培养条件不同变化极大，但谘殖浞质倍辔10:1 。以往认为磷施入后易沉淀应多施些，因此推荐施肥中氮、磷的质量比为4:1或2:1，甚至1:1 。然而除了易沉淀以外，考虑到水中磷循环和被利用的一些特点，过高的施磷量未必有利 。首先磷在有机质中结合较不紧密，细胞死后大部分磷在酶的作用下以磷酸盐
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