酒精分子有两个末端，一个末端是疏水性（-C2H5），可破坏蛋白质内部疏水基团之间的吸引力；一端是亲水性的（-0H），但很难破坏亲水性蛋白质外部基团之间的吸引力 。另一方面，水分子虽然可以缓和亲水性蛋白质组间的吸引力，但即使渗透到细菌内部，也不能破坏疏水性蛋白质组间的吸引力 。因此，纯酒精或水不足以使细菌中的蛋白质变性，只有当酒精和水共存时，放松保持蛋白质形状的各种吸引力，蛋白质才会失去生理活性 。因此，只有保持适度浓度的酒精溶液才可以达到优秀的消毒灭菌目的 。
为什么不能用95%的酒精消毒【为什么不能用95%酒精消毒 为什么不能用95度的酒精消毒】95%（高浓度）酒精渗透入菌体蛋白迅速凝固形成坚固的菌膜，影响酒精渗透入菌体，而降低了消毒效果，所以不能用于消毒 。
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