另有各特殊警种的军级武警指挥部，上述单位统归大军区级别的武警总部指挥，所以武警部队司令员多为上将衔 。（少校和尚）既然主官有中队长、大队长、支队长和总队长的职称，那么副职当然就是副中队长、副大队长、副支队长和副总队长 。作为主官的副手，这些“副队长”的职能和分工，其实跟解放军各级副职大同小异，比如武警支队，就会设置支队长（正团级）、政委、副支队长（未必只设一名）、副政委和参谋长等一整套班子 。
副中队长和副大队长的职责跟解放军类似，根据内务条令，副职主要协助中队长和大队长的工作，当主官因故不在岗位或者在战时出现伤亡时，由副职代理中队长或大队长的职务 。在风平浪静的和平时期，副职主要负责部队的日常训练和后勤管理，因为主官要负责部队的全面工作，副职当然就要搞好日常 。在支队以上建制单位中，副职可能会设置两名甚至更多，按排名的话，第一副支队长、副总队长主抓部队训练，第二副职则主管装备和后勤，其实这是历史传承下来的惯例 。
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