大顺二年(891年)十月初六日 ， 唐昭宗正式任命王建为检校司徒、成都尹、剑南西川节度副大使知节度事、管内观察处置云南八国招抚等使 。
王建既得西川 ， 留心政事 ， 容纳直言 ， 好施乐士 ， 谦恭简素 ， 用人各尽其才 。但猜忌好杀 ， 诸将有功者 ， 多因事被诛 。
吞并东川
王建攻陷成都一个月后 ， 东川节度使顾彦朗病逝 ， 其弟顾彦晖继任 。十二月 ， 唐昭宗命宦官宗道弼(一作宋道弼)为使 ， 赐顾彦晖旌节 。绵州(今绵阳)刺史常厚(杨守厚)拘押宗道弼 ， 并攻打梓州(今三台) 。王建得知后派建遣李简、华洪(即王宗涤)等人讨伐常厚 。此时的王建已有吞并东川之心 ， 对李简等人道：“你们击破常厚 ， 顾彦晖一定会犒军 ， 倒是把他一起拿下 。”李简等人在钟阳击败常厚 ， 夺回旌节 ， 让宗道弼将其送到顾彦晖处 。顾彦晖得到旌节后 ， 却因王建养子王宗弼的通风报信而称病不肯犒军 ， 王建的计划落空 。
景福二年(893年) ， 王建被加封为同平章事 。乾宁二年(895年) ， 邠宁节度使王行瑜、镇国节度使韩建、凤翔节度使李茂贞联合进逼京师 ， 诛杀宰相韦昭度、李溪 ， 并谋废唐昭宗 。李克用在河东起兵勤王 ， 王建也派简州刺史王宗瑶带兵救驾 。同年 ， 王建以顾彦晖不出兵为由 ， 命王宗涤讨伐东川 。不久 ， 王宗涤在楸林击败顾彦晖 ， 斩杀敌将罗璋 ， 进围梓州 。
乾宁三年(896年) ， 王建在唐昭宗的诏令下 ， 罢兵返回成都 。同年七月 ， 李茂贞再次进犯京师 ， 烧毁宫殿 ， 唐昭宗逃往华州(今陕西华县) 。王建得知后 ， 上表请求皇帝迁都成都 。不久 。王建被任命为凤翔西面行营招讨使 ， 讨伐李茂贞 。
乾宁四年(897年) ， 王建再次命王宗涤攻打东川 ， 又命王宗谨攻打凤翔 。不久 ， 王建命王宗侃取渝州、王宗阮取泸州 ， 开通峡路 。同年五月 ， 王建亲自率兵攻打东川 。不久 ， 唐昭宗任命谏议大夫李洵为两川宣谕使 ， 诏令王建罢兵 。王建不肯奉诏 。唐昭宗贬王建为南州刺史 ， 任命李茂贞为西川节度使 。李茂贞拒绝接受任命 ， 唐昭宗只得恢复王建官爵 。十月 ， 梓州城破 ， 顾彦晖自杀 ， 王建任命王宗涤为东川留后 。
加封蜀王
光化三年(900年) ， 王建兼任中书令 ， 东川、信武军两道都指挥制置等使 ， 赐爵琅琊王 。天复元年(901年) ， 王建被改封为西平王 。同年 ， 宦官韩全诲将唐昭宗劫持到凤翔 ， 被梁兵围在城中 。李茂贞坚守不住 ， 打算求和 。王建暗中派人劝说李茂贞 ， 让其坚守城池 ， 并称自己会出兵救援 。不久 ， 王建派王宗涤攻取兴元 。天复二年(902年) ， 武定节度使拓跋思敬归降王建 ， 王建终于得以兼并山南西道 。天复三年(903年) ， 荆南节度使成汭兵败身死 ， 王建趁机夺取夔州(今重庆奉节东)、施州(今湖北恩施)、忠州(今重庆忠县)和万州(今重庆万县) 。八月 ， 王建被封为守司徒 ， 进爵蜀王 。
天复四年(904年) ， 王建与李茂贞修好 ， 将女儿(即普慈公主)嫁给李茂贞的侄子李继崇 。不久 ， 朱温弑唐昭宗 ， 立唐哀帝 ， 并迁都洛阳 ， 改元天祐 。但王建仍使用天复年号 ， 并在成都设立行台 ， 自行任命官员 。天复六年(906年) ， 王建取归州(今湖北秭归县) ， 占有三峡之地 。
